灰原哀收到神秘邀请函，与柯南一行登上豪华列车“黑铁”。途中，乘客接连遭遇暗杀，现场留下神秘暗号。灰原察觉这可能是黑衣组织设下的陷阱，而幕后黑手竟是代号波本的安室透。在封闭车厢内，灰原必须直面过去阴影，与柯南联手破解谜局。他们发现列车藏有致命毒气装置，组织意图清除叛徒雪莉。生死关头，灰原毅然选择保护同伴，却意外暴露身份。本片深度刻画灰原哀的内心挣扎与成长，反转结局令人动容，是柯南系列中不可错过的灰原哀个人篇章。